藥用凍干機一般均在同一個干燥箱體內的一組擱板上完成預凍、保溫、升華干燥全部工藝過程。由于同一組擱板既要具備制冷又要實現加溫，凍干機所以一般均采用中間媒介進行間接傳導，擱板溫度不均勻和托盤導熱不良好的問題導致能耗大、工藝過程長、沒有達到產品設計殘余含水量標準等問題是長期困繞制藥企業(yè)發(fā)展的一個關鍵因素。
藥用凍干機根據各個生物制品的特性要求，配合相應的凍干工藝技術處理，使制品物理結構不變，化學結構變化很小，生物制品保持原有的固體結構和形態(tài)，在升華干燥過程中，固體冰晶升華成水蒸氣后在制品中留下孔隙，形成海綿狀多孔性結構，具有理想的速溶性和近乎完全的復水性。
凍干機一般都將原料裝在托盤內放置在擱板上的托盤內進行凍結、升華干燥、解析干燥的加工，托盤的厚度應要考慮到冷熱變形，因此不能太薄，一般在1.5mm左右，裝有Y品的西林瓶或食品在托盤內盛裝高度約10-15Mm左右，溫度由擱板的冷熱溫度傳遞到托盤底部開始直到上端的凍結、升華干燥、解析干燥物品為止。但由于裝有藥品的西林瓶、Y品、小型凍干機生物制品或食品在托盤內盛裝高度約10-15mm左右，溫度的傳遞需要較長時間，再由于擱板溫度不均勻，造成了凍干產品含水率不均勻，產品殘余含水量的合格率受影響。
很多凍干制品的生產需要用到冷凍干燥機，合理而有效地縮短凍干的周期在工業(yè)生產上具有明顯的經濟價值。經冷凍干燥處理的物品易于長期保存，加水后能恢復到凍干前的狀態(tài)并保持原有的生化特性。為了使藥用冷凍干燥機向著更有利于產品生產的方向發(fā)展，并且能夠在確保產品質量的同時，提高生產效率、減少資源浪費和方便生產操作。
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